自前サーバーで運用中のDNSなんですが
ローカル接続された端末からDNS参照すると、タイムアウトしたり、なんか重かったんです・・・
原因が分からず、諦めて、外部DNS参照してました。

昨日、ふとIPV6が怪しいと思って止めてみたら、タイムアウトしなくなりました
これが原因だったとは・・・

/etc/modprobe.confに
「install ipv6 /sbin/modprobe -n -i ipv6」を追加

設定参照
http://d.hatena.ne.jp/adsaria/20070922
この記事書いてる人は凄い詳しいっすね